改额为东林禅寺。至正元年（1341年）毁于兵灾。明初僧至益重建，

　　后因年久失修而倾毁。清乾隆年间陈克己等重建，道光五年（1825年）大殿毁于火。道光九年（1829年）僧念怀又重建。1998年5月由上海市文物管理委员会出资予以修缮，大殿整体顶升60公分，同年12月竣工。此殿座北朝南，砖木结构，重檐歇山顶，通高15.2米，面阔5间带轩廊，进深6间，建筑面积351平方米。脊饰华美，每只戗脊有3只蹲兽，木内柱和梁架粗大，斗拱密布有序，上下檐的外檐斗拱均是一斗六升大斗拱，殿前后共12根檐柱。现为上海地区佛教建筑中单体体量最大的古建筑。1987年公布为市级文物保护单位。