清水岩寺宇在蓬莱主峰500米处，为北宋普足禅师首创。寺宇依山而建，背靠狮形龙脉，面临深壑，远处文笔三峰拱峙，周遭蓬莱群峰环合。普足禅师居岩十九年，“造成通泉、谷口、汰口诸桥、砌洋中亭路，糜费巨万，资于施者”，又建造洋中亭，作为治病救人的义诊之所。经十八年募捐创建，岩宇告成。建中靖国元年（1101）五月十三日，普足禅师圆寂，乡人刻沉香木为像，供在岩寺中，奉号清水祖师。从南宁景炎（1277年）到近代，清水岩经续建、重建、扩建、改建、重修达三十多次。岩宇作楼阁式，分三层。第一层昊天口，第二层祖师殿，第三层释迦楼；钟鼓楼、檀越祠、观音厅、芳名厅、僧舍等分立于东西两边。崇楼曲阁，层迭回护，从远一看，外观犹如“帝”字，气势磅礴，巍峨壮观，相传有九十九间房屋，现存为明清及近代建筑。山门立于洋中鹤前大桥头的景区处，三门牌坊式建筑，为一九九八年秋后新建。中门高5.5米,宽4.00米,左右边门各高5.00米,宽1.8米，顶盖琉璃瓦，飞檐出水，总高达8米,庄严肃穆,堂皇矗立。石坊刻着中国佛学院教授、书法家虞愚先生题写的“清水岩”牌额和“拜参千佛坐；同享十方春”的对联。山门左侧有“清珠帘”，即道旁悬崖峭壁上，每逢春夏两季，石缝里会迸出如珍珠的水滴，阳光一照，美似五颜六色的珠帘垂挂。

　　景区内有许多奇观异景、文物古迹点缀其间。首先是朝圣阶，共108级。两旁扶栏各36根花岗岩立柱，柱头雕十二生肖动物，供善信和游客择其相应物象抚摩而上，寄意“心诚则灵”、“步步高升”。上了朝圣阶，沿途有出水石、海会园、三忠庙、枝枝朝北树、觉亭、纶音坛、岩图碑、罗汉松、圣泉、方鉴塘、裂竹，进清水法门，过石面盆便到蓬莱祖殿。中殿神龛筑于巨石之上，其下有窍然深邃的岩洞“狮喉”。祖殿后岩上有埋藏清水祖师骨灰的宋代“真空塔”，真空塔左顶有“窥天古樟”。离窥天古樟不远处的丛林中有“试剑石”。此外还有瞰龙亭、清水山庄、龙宫等。其中最引人注目的是枝枝向北树。这是一株七个孩童展手相拉难于合抱的古樟树，相传南宋初，抗金民族英雄岳飞被奸臣秦桧所害，感动了这株樟树，故枝叶全向北伸长，以表悼念和崇敬。最珍贵的是“岩图碑”,系宋时以平面浮雕清水岩寺的建筑规制和总体布局，是历代续建、重修的依凭，为国内所罕见。清水岩景区散布着二十多方摩崖石刻，时历宋、元、明、清以至现代，书体，有篆、隶、楷、行，以楷、行最多。在景区的最高处还有四枝石笋，拔地而起，嶙峋俏丽。若从蓬菜鹤前桥起步，沿途还有半岭亭、护界宫、袈裟石、丹臼、石鸡、石狗等千姿百奇的奇岩怪石。真是天然景致美不胜收，游人至此恍如置身于“蓬菜仙境”之中。